المعلوماتية الحيوية العملية: المهام اليومية باستخدام Python و Biopython

يولد البحث البيولوجي الحديث كميات هائلة من البيانات، مما يجعل التحليل اليدوي بطيئًا وعرضة للأخطاء. تعلم أتمتة مهام التسلسل اليومية هو المفتاح لتسريع اكتشافاتك العلمية وإدارة البيانات بكفاءة. ترشدك هذه الدورة من أساسيات البرمجة المطلقة إلى تنفيذ سير عمل المعلوماتية الحيوية العملية. ستبدأ بمفاهيم Python الأساسية، وإعداد البيئة الحديثة، وتتقدم تدريجيًا إلى تحليل التسلسلات الجينية، والاستعلام عن قواعد البيانات العالمية، وإجراء المحاذاة. ما ستتعلمه: - فهم برمجة Python الأساسية، بما في ذلك المتغيرات، والتحكم في التدفق، والحلقات، وإعداد البيئة الافتراضية الحديثة. - الاستعلام عن قاعدة بيانات NCBI برمجيًا باستخدام Entrez للبحث عن البيانات البيولوجية واستردادها. - قراءة وكتابة وتحويل تنسيقات ملفات التسلسل الشائعة باستخدام SeqIO لأتمتة تحليل البيانات. - إجراء النسخ والترجمة وتحليلات التسلسل الأساسية مثل محتوى GC وحسابات الوزن الجزيئي. - تنفيذ محاذاة التسلسل المزدوجة والمتعددة لتحديد العلاقات التطورية. - تشغيل عمليات بحث BLAST برمجيًا للعثور على أوجه التشابه في التسلسل عبر قواعد البيانات العالمية. تبدأ الدورة بمفاهيم البرمجة الأساسية وتكوين البيئة، مما يضمن حصولك على أساس متين قبل الانتقال إلى تطبيقات Biopython العملية، وتكامل قواعد البيانات، وتقنيات محاذاة التسلسل. تم تصميم هذه الدورة لعلماء الأحياء والباحثين والطلاب الجدد في البرمجة والذين يرغبون في تطبيق Python على سير عملهم العلمي اليومي. لا توجد خبرة سابقة في البرمجة مطلوبة. ابدأ في بناء مجموعة أدوات المعلوماتية الحيوية الخاصة بك وتبسيط سير عمل تحليل البيانات اليوم.