Fundamentos de Bioinformática: Gráficos y Ensamblaje de Genomas

Reconstruir un genoma completo a partir de fragmentos de ADN es uno de los retos computacionales más importantes en la biología moderna.Este curso de solo texto le presenta los conceptos fundamentales de la teoría de grafos que hacen posible el ensamblaje del genoma. Al leer nuestras lecciones estructuradas, pasará de comprender gráficos matemáticos básicos a analizar cómo se estructuran y resuelven los datos biológicos complejos utilizando rutas algorítmicas. Obtendrá las herramientas conceptuales necesarias para comprender cómo los ensambladores modernos unen los códigos genéticos.\n\nLo que aprenderá:\n- Comprender la anatomía básica de los gráficos, incluidos los nodos, las aristas, los caminos dirigidos y los ciclos.\n- Explorar las diferencias entre los enfoques de gráfico de superposición, diseño y consenso (OLC) y De Bruijn.\n Los caminos Hamiltonianos se usan para reconstruir secuencias de ADN.\n- Identificar desafíos comunes de ensamblaje tales como repeticiones genómicas, errores de secuenciación y burbujas gráficas.\n - Aprenda cómo los gráficos modernos de pangenomas representan la variación genética más allá de un genoma de referencia único.\n\nEl curso comienza con las definiciones básicas de la teoría de grafos antes de guiarlo paso a paso Reforzará su lectura con ejercicios conceptuales escritos diseñados para poner a prueba su comprensión de la lógica algorítmica, y aprenderá a utilizar los algoritmos de ensamblaje para resolver problemas de bioinformática. Este curso está diseñado para principiantes entusiastas de la bioinformática, estudiantes de biología y programadores que buscan comprender la intersección de la informática y la genética, sin necesidad de tener conocimientos previos en teoría de grafos avanzada o biología.Comience a explorar las estructuras matemáticas que impulsan el descubrimiento genómico moderno hoy.