Algoritmos de ensamblaje de genomas con gráficos de De Bruijn emparejados

Reconstruir un genoma completo a partir de miles de millones de lecturas de ADN minúsculas y fragmentadas es uno de los retos computacionales más importantes en la biología moderna.Este curso basado en texto le presenta los conceptos algorítmicos básicos detrás del ensamblaje del genoma, centrándose en cómo las lecturas emparejadas resuelven el problema de resolución de repetición. Al comprender cómo los datos biológicos se traducen en estructuras matemáticas, obtendrá una perspectiva clara de cómo los ensambladores modernos mapean el código de la vida. Construirá una base teórica sólida en la teoría de grafos aplicada a la bioinformática, pasando de los conceptos básicos de secuencia a las técnicas avanzadas de A través de explicaciones escritas claras, aprenderá a modelar datos genómicos y resolver las ambigüedades estructurales que surgen durante la secuencias. Lo que aprenderás: - Comprender los conceptos fundamentales de los k-mers, las lecturas de secuenciación de ADN y las limitaciones de la secuencias de extremo único. - Construir gráficos de De Bruijn a partir de datos de secuencia y representar computacionalmente k-meros superpuestos. - Aplicar algoritmos de ciclo y trayectoria euleriana para reconstruir secuencias genómicas originales. - Resolver el problema de repetición en el ensamblaje de genomas utilizando gráficas de De Bruijn emparejadas y pares de lectura. - Explore los conceptos modernos de ensamblaje híbrido que combinan técnicas de gráficos de lectura corta con datos de secuenciación de lectura larga. El curso comienza con la terminología biológica y algorítmica esencial antes de guiarlo paso a paso a través de la construcción de gráficos, la búsqueda de caminos y la reconstrucción de secuencias.Consolidará su aprendizaje a través del recorrido algorítemico escrito y los ejercicios conceptuales basados en texto. Este curso está diseñado para principiantes en bioinformática, estudiantes de ciencias de la computación o entusiastas de la biología que buscan comprender las matemáticas detrás del ensamblaje de secuencias.No se requiere experiencia previa en teoría de grafos avanzada o biología. Comience a leer hoy para desbloquear los secretos algorítmicos de la secuenciación genómica.