16S Metabarcoding dan Analisis Metagenomik dengan Galaxy

Mengerti dunia yang rumit dari komunitas mikroba sangat penting untuk penelitian biologi dan medis modern, namun data pengurutan mentah bisa terasa membingungkan. Kursus berbasis teks ini mengajarkan Anda cara memproses dan menafsirkan data rRNA 16S menggunakan Galaxy, sebuah platform berbasis web yang kuat yang tidak memerlukan pemrograman. Pada akhir kursus ini, Anda akan bertransisi dari seorang pemula menjadi analis yang percaya diri dan mampu menjalankan pipa metagenomik standar. Anda akan membaca penjelasan yang jelas, memahami konsep biologi dasar, dan belajar bagaimana menafsirkan profil taksonomi. Apa yang Anda pelajari: Mengerti konsep dasar pengurutan rRNA 16S, metabarcoding, dan metagenomics; Navigasi antarmuka platform Galaxy untuk mengunggah data, menjalankan alat, dan mengelola sejarah; Lakukan kontrol kualitas dan pra-proses pada pembacaan pengurutan mentah untuk memastikan hasil yang dapat diandalkan; Klasifikasi kelompok taksonomi dan bandingkan data. Unit Taksonomi (OTU) dengan Varian Urutan Amplicon (ASV) modern; Interpretasi metrik keanekaragaman ekologi dan plot kelimpahan taksonomi untuk menarik kesimpulan biologis. Anda akan belajar untuk mengkonfigurasi alat, menghubungkan tugas bersama, dan memperbaiki masalah kualitas data umum. Kursus ini dirancang untuk pemula, siswa, dan peneliti ilmu kehidupan yang ingin menganalisis data mikrobiome tanpa menulis kode baris perintah. Tidak diperlukan pengalaman pemrograman atau bioinformatika sebelumnya. Mulai perjalanan Anda ke analisis data mikroba dan membuka rahasia mikroba hari ini.