16S Metabarcoding ve Metagenomics Galaxy ile Analiz

Mikrobik toplulukların karmaşık dünyasını anlamak modern biyolojik ve tıbbi araştırmalar için gereklidir, ancak ham dizileme verileri baskılayıcı olabilir. Bu metin tabanlı kurs, sıfır programlama gerektiren güçlü bir web tabanlıdır Galaxy kullanarak 16S rRNA verilerini nasıl işleyip yorumlayacağınızı öğretiyor. Bu dersin sonunda, standart metagenomik boru hatlarını çalıştırabilen güvenilir bir analist olmak için başlangıç seviyesinden geçiş yapmış olacaksınız. net açıklamaları okuyacak, altta yatan biyolojik kavramları anlayacak ve taksonomik profilleri yorumlamayı öğreneceksiniz. Ne öğreneceksiniz: 16S rRNA dizileme, metabarkodlama ve metagenomiklerin temel kavramlarını anlamak; Galaxy platform arayüzünü veri yüklemek, araçlar çalıştırmak ve geçmişi yönetmek için yönlendirin; Güvenilir sonuçlar elde etmek için ham dizi okumalarında kalite kontrolü ve ön işleme yapın; Taksonomik grupları sınıflandırın ve Operatif Modern Amplicon Sequence Variants (ASVs) ile Taksonomik Birimler (OTUs); Biyolojik sonuçlar çıkarmak için ekolojik çeşitlilik metrikleri ve taksonomik bolluk çizelgelerini yorumlayın. Kurs, tam bir veri analizi boru hattında adım adım rehberlik etmeden önce çekirdek terminoloji ve işaretleyici gen dizilemesinin arkasındaki teori ile başlar. Araçları nasıl ayarlayacağınızı, görevleri bir araya nasıl bağlayacağınızı ve yaygın veri kalitesi sorunlarını nasıl çözeceğinizi öğreneceksiniz. Bu ders, mikrobiyoloji verilerini komut satırı kodu yazmadan analiz etmek isteyen yeni başlayanlar, öğrenciler ve yaşam bilimleri araştırmacıları için tasarlanmıştır. Önceden programlama veya biyoenformatik deneyimi gerekmez. Mikrobiyolojik veri analizi yolculuğunuza başlayın ve mikrobiyomun sırlarını bugün açığa çıkarın.